2、垂线上取样水深的确定：在一条垂线上，水深大于5m时，在水面下0.5m 水深处及在距河底0.5m处各取样一个；水深为1`5m时，只在水面下0.5m处取一个样；在水深<1m时，取样点距水面不应小于0.3m，距河底也不应小于0.3m.对于三级评价的小河不论河水深浅，只在一条垂线上一个点取一个样，一般情况下取样点应在水面下0.5m处，距河底不应小于0.3m.
3、取样方法：
一级评价：每个取样点的水样均应分析，不取混合样；二、三级评价：需要预测混合过程段水质的场合，每次应将该段内各取样断面中每条垂线上的水样混合成一个水样。其它情况每个取样断面每次只取一个混合水样。
湖泊、水库：
1、取样位置上取样点的布设：
(1)大、中型湖泊与水库：平均水深小于10m时，取样点设在水面下0.5m处，但距湖库底不应小于0.5m.平均水深大于等于10m时，首先应找到斜温层。在水面下0.5m及斜温层以下，距湖库底0.5m以上处各取一个水样。
(2)小型湖泊与水库：平均水深小于10m时，水面下0.5m，并距湖库底不小于0.5m处设一取样点。平均水深大于等于10m时，水面下0.5m处和水深10m，并距底不小于0.5m处各设一取样点。
2、取样方法：
(1)小型湖泊与水库：如水深小于10m时，每个取样位置取一个水样；如水深大于等于10m时，则一般只取一个混合样，在上下层水质差距较大时，可不进行混合。
(2)大、中型湖泊与水库：各取样位置上不同深度的水样均不混合。
河口：取样点的布设和取样方法与河流部分相同。
海湾与近海水体：
1、取样点布设：水深小于等于10m时，只在水面下0.5m处取一个水样，此点与海底的距离不小于0.5m.水深大于10m时，在水面下0.5m处和水深10m，并距海底不小于0.5m处分别设取样点。
2、取样方法：每个取样位置一般只有一个水样，即在水深大于10m 时，将两个水深所取的水析混合成一个水析，但在上下层水质差距较大时，可以不进行混合。